Misją Muzeum jest upowszechnianie sztuki polskiej i światowej zgromadzonej w kolekcji XX. Czartoryskich, wypełnianie ideowego testamentu księżnej Izabeli zawartego w słowach „PRZESZŁOŚĆ PRZYSZŁOŚCI”, kształtowanie postawy patriotycznej przejawiającej się we wspólnej odpowiedzialności za dziedzictwo narodowe i kulturowe zgodne z wartościami kultywowanymi w Puławach – Polskich Atenach.